西北區域次氯酸鈉投加系統水處理裝置的殺滅作用是通過水解產生次氯酸，然后分解產生新的生態氧。其強大的氧化活性使細菌和病毒表面的蛋白質變性，從而殺死病原微生物。其實氯消毒的原理主要是通過產生次氯酸，然后釋放新的生態氧來進行的。二是在滅菌解毒過程中，次氯酸不僅能作用于細胞壁和病毒外殼，而且由于其分子小，不帶電荷，能滲入細菌（病毒），與細菌（病毒）中的蛋白質、核酸、酶等有機高分子物質發生反應，殺死病原微生物。在此基礎上，次氯酸產生的氯離子可顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，次氯酸鈉發生器可使細胞失去活力，導致細胞死亡。

此外，西北區域次氯酸鈉投加系統水處理裝置還可以分解蔬菜、水果等農副產品上殘留的微量藥物。大多數農藥都是由有機物組成的，次氯酸鈉發生器釋放的新氧氣可以氧化分解這些物質。這無疑將對現代農業和果蔬包裝行業的發展起到重要的推動作用。也可以肯定的是，由于次氯酸鈉發生器產生的消毒劑不像氯、二氧化氯等消毒劑那樣在水中產生游離氯，所以由于游離氯的存在，一般很難形成對人體有害的致癌物；不像臭氧，只要空氣中有微弱的量（0.001mg/m），就會對生命造成傷害和毒害。此外，由于氯氣與水反應生成鹽酸，次氯酸鈉發生器的水消毒不會對金屬管造成嚴重腐蝕。