通過研究臭氧對水中銅綠微囊藻的殺滅效果，可以得出淡水除藻設備臭氧發生器有著明顯的作用。結果表明，隨著臭氧用量和作用時間的延長，銅綠微囊藻的殺滅率明顯提高。隨著溫度的升高，臭氧滅活銅綠微囊藻的能力減弱；臭氧在堿性條件下對銅綠微囊藻的殺滅能力強于酸性條件。藻類的初始濃度對殺滅效果影響很大。細胞密度增加，殺傷效果急劇下降。當初始細胞密度為1.0×107個/L，臭氧用量為2.0mg/L，作用時間在40min以上時，在飲用水消毒的濁度、溫度和pH值范圍內，對銅綠微囊藻的殺滅率為99%。

淡水湖水華發生的頻率和嚴重程度不斷增加，其中藍藻是造成水華污染的主要藻類。水中藻類的增殖不僅使水質惡化，還影響飲用水的處理和安全，威脅飲用水的安全：部分藻類釋放藻毒素，造成人畜疾病甚至死亡，藻類細胞及其胞外分泌物在氯化過程中產生三鹵甲烷、鹵乙酸、鹵代乙二胺等物質；帶鞭毛的藻細胞容易穿透絮體，破壞絮凝過程，導致出水存在藻細胞；濾床內藻類細胞的生長會導致濾床堵塞。上述問題的存在，說明藻類在飲用水處理中的影響不容忽視。

雖然預氯化對滅活藻類等微生物、輔助混凝、提高藻類和水顆粒的去除效果良好，但氯氧化或消毒產生的消毒副產物已引起國內外飲用水處理界的高度重視。作為氯預氧化的理想替代物，淡水除藻設備臭氧發生器的臭氧氧化和強化混凝是控制消毒副產物的較好可行技術。